提交应用
提交 3.0 版本应用
3.0 应用开发指南
登录
所有应用
分类
数据可视化
(78)
网络分析
(64)
网络生成
(63)
图分析
(60)
自动化
(48)
在线数据导入
(47)
聚类
(39)
综合分析
(37)
系统生物学
(33)
可视化
(32)
实用工具
(32)
富集分析
(32)
数据集成
(27)
核心应用
(25)
注释
(24)
布局
(22)
导入
(19)
通路数据库
(18)
本体分析
(18)
基因表达
(18)
PPI网络
(16)
网络比较
(16)
本地数据导入
(16)
交互数据库
(16)
功能分析
(16)
网络结构
(14)
脚本编写
(13)
调控网络
(13)
网络动力学
(13)
GO注释
(12)
拓扑学
(10)
网络推断
(10)
热图可视化
(10)
导出
(10)
通路
(9)
网络
(9)
网络操作
(9)
功能模块检测
(9)
疾病
(9)
癌症数据分析
(9)
网络划分
(8)
基因调控
(8)
数据库
(8)
属性生成
(8)
动画
(8)
分子结构
(7)
关联数据
(7)
ID映射
(7)
分组
(7)
基因-疾病关联
(7)
连接子图发现
(7)
中心性分析
(7)
3D可视化
(7)
仿真
(6)
带重启随机游走算法
(6)
网络学习
(6)
微阵列
(6)
基因共表达
(6)
聚类可视化
(6)
社交网络分析
(5)
最短路径
(5)
序列相似性
(5)
SBML
(5)
R语言
(5)
蛋白质复合物
(5)
通路查找
(5)
网络比对
(5)
基因优先级排序
(5)
数据操作
(5)
结构生物学
(4)
SPARQL
(4)
信号传导
(4)
搜索
(4)
文献挖掘
(4)
KEGG
(4)
JavaScript
(4)
基因功能预测
(4)
通量分析
(4)
贝叶斯网络
(4)
变异分析
(3)
子网提取
(3)
集合可视化
(3)
集合分析
(3)
Python
(3)
蛋白质动力学
(3)
翻译后修饰
(3)
通路重建
(3)
通路分析
(3)
非编码RNA
(3)
网络仓库
(3)
推断
(3)
图聚类
(3)
基因组可视化
(3)
药物重定位
(3)
疾病模块
(3)
疾病-疾病关联
(3)
Cytoscape
(3)
社区检测
(3)
癌症
(3)
布尔网络
(3)
可视化
搜索关于可视化的帖子 →
提问关于可视化的问题 →
ANIMO
ANIMO(交互式建模网络分析)允许您对生物网络进行建模,并将它们的动态过程与实验数据进行比较。
ANIMO
ANIMO(交互式建模网络分析)允许您对生物网络进行建模,并将它们的动态过程与实验数据进行比较。
(1) 48105 次下载
clusterMaker2
用于 Cytoscape 的多算法聚类应用
clusterMaker2
用于 Cytoscape 的多算法聚类应用
(28) 178232 次下载
cymirCNV
miRNA 基因相关网络可视化
cymirCNV
miRNA 基因相关网络可视化
(1) 1042 次下载
CySpanningTree
生成树计算及旅行商问题的最小生成树(MST)启发式算法
CySpanningTree
生成树计算及旅行商问题的最小生成树(MST)启发式算法
(5) 7475 次下载
DynDiffNet
用于动态差异网络构建、分析和可视化的 Cytoscape 应用
DynDiffNet
用于动态差异网络构建、分析和可视化的 Cytoscape 应用
(0) 1289 次下载
DyNetViewer
Cytoscape 3.0 中动态网络的构建、分析和可视化
DyNetViewer
Cytoscape 3.0 中动态网络的构建、分析和可视化
(4) 13123 次下载
enhancedGraphics
用于图表和渐变的直通映射工具
enhancedGraphics
用于图表和渐变的直通映射工具
(11) 167583 次下载
eXamine
一种面向集合的注释模块可视化分析方法,它在节点链接布局之上以轮廓的形式显示集合成员关系。
eXamine
一种面向集合的注释模块可视化分析方法,它在节点链接布局之上以轮廓的形式显示集合成员关系。
(34) 24724 次下载
Highlighter
基于共享的自定义节点注释来高亮和选择节点。
Highlighter
基于共享的自定义节点注释来高亮和选择节点。
(1) 3633 次下载
KEGGscape
用于 KEGG XML (KGML) 文件的文件读取器和通路可视化工具
KEGGscape
用于 KEGG XML (KGML) 文件的文件读取器和通路可视化工具
(4) 110117 次下载
NCMine
通过近团挖掘(Near-Clique Mining)查找基因网络中的功能模块
NCMine
通过近团挖掘(Near-Clique Mining)查找基因网络中的功能模块
(3) 4657 次下载
PathInsight
一个开源应用程序,用系统生物学图形符号(SBGN)对通路中小分子结合的影响进行建模
PathInsight
一个开源应用程序,用系统生物学图形符号(SBGN)对通路中小分子结合的影响进行建模
(1) 3931 次下载
RNA
调控网络分析器(Regulatory Network Analyzer)可生成/分析调控网络和状态转移网络,并计算熵等信息。
RNA
调控网络分析器(Regulatory Network Analyzer)可生成/分析调控网络和状态转移网络,并计算熵等信息。
(2) 14144 次下载
SAFE
功能富集空间分析(Spatial Analysis for Functional Enrichment)
SAFE
功能富集空间分析(Spatial Analysis for Functional Enrichment)
(0) 8471 次下载
stringApp
从 STRING 导入并增强 Cytoscape 网络
stringApp
从 STRING 导入并增强 Cytoscape 网络
(34) 387515 次下载
yFiles Layout Algorithms
用于排列网络的高度复杂的算法。
yFiles Layout Algorithms
用于排列网络的高度复杂的算法。
(30) 253578 次下载
boundaryLayout
具有自定义边界约束的力导向网络布局
boundaryLayout
具有自定义边界约束的力导向网络布局
(2) 13768 次下载
CyAnimator
用于 Cytoscape 的简单关键帧动画
CyAnimator
用于 Cytoscape 的简单关键帧动画
(5) 51379 次下载
cyPlot
用于显示数据绘图的实用工具
cyPlot
用于显示数据绘图的实用工具
(1) 49610 次下载
DeDaL
数据驱动布局(PCA...)、网络比对、网络变形。
DeDaL
数据驱动布局(PCA...)、网络比对、网络变形。
(1) 6011 次下载
DyNet
比较两个或多个网络,并确定“重连”最多的节点。
DyNet
比较两个或多个网络,并确定“重连”最多的节点。
(7) 15200 次下载
EClerize
EClerize
(2) 2320 次下载
EntOptLayout
基于相对熵优化的布局插件
EntOptLayout
基于相对熵优化的布局插件
(6) 14222 次下载
FunCoup
从 FunCoup 导入并分析 Cytoscape 网络
FunCoup
从 FunCoup 导入并分析 Cytoscape 网络
(10) 2675 次下载
IntAct App
从 IntAct 数据库构建分子相互作用网络。一键访问所有详细信息。
IntAct App
从 IntAct 数据库构建分子相互作用网络。一键访问所有详细信息。
(7) 17418 次下载
Legend Creator
为您的图形添加离散和连续映射图例的方法
Legend Creator
为您的图形添加离散和连续映射图例的方法
(5) 34779 次下载
Omics Visualizer
为同一个节点导入并可视化多种数据
Omics Visualizer
为同一个节点导入并可视化多种数据
(10) 23423 次下载
PhosphoPath
定量蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学数据集的可视化与分析
PhosphoPath
定量蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学数据集的可视化与分析
(17) 29282 次下载
RWRMTN
基于 microRNA-靶基因网络预测疾病相关 microRNA 的工具
RWRMTN
基于 microRNA-靶基因网络预测疾病相关 microRNA 的工具
(4) 3724 次下载
SemScape
可视化语义数据景观
SemScape
可视化语义数据景观
(36) 7400 次下载
XlinkCyNET
生成蛋白质相互作用网络中由 XL-MS 提供的残基间连接
XlinkCyNET
生成蛋白质相互作用网络中由 XL-MS 提供的残基间连接
(4) 28804 次下载
Cytoscape 2.x 不支持的插件
ClustnSee
对大型网络中的簇进行识别、可视化和分析
ClustnSee
对大型网络中的簇进行识别、可视化和分析
(14)