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CHAT
识别生物网络中与语境相关的枢纽(hubs)
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CytoDiVR
在虚拟现实中深入探索您的 Cytoscape 网络
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CytoMOBAS
识别并分析与疾病相关的且高度连接的子网络。
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HGPEC
HGPEC 可以有效预测新的疾病-基因和疾病-疾病关联,并支持基于网络和排名的可视化
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NeDRex
寻找药物重定位候选者和疾病模块。构建自定义的异构分子网络并支持探索功能
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Pesca3.0
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scNetViz
在 Cytoscape 中进行单细胞 RNASeq 分析
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Strongest Path
用于蛋白质-蛋白质相互作用分析的应用程序
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CyNetSVM
一个使用网络约束支持向量机(SVM)进行癌症生物标志物识别的 Cytoscape 应用
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CytoGEDEVO
PPI 或其他网络的成对全局对齐
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DeDaL
数据驱动布局(PCA...)、网络对齐、网络变形。
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IntAct App
从 IntAct 数据库构建分子相互作用网络。一键获取所有详细信息。
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PEmeasure
计算链接权重并评估网络中链接的可靠性(例如蛋白质-蛋白质相互作用)
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PEWCC
在网络(如 PPI/基因网络)中检测密集子网络(如蛋白质/基因复合物)
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stringApp
从 STRING 导入并增强 Cytoscape 网络
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XlinkCyNET
生成由蛋白质相互作用网络中的 XL-MS 提供的残基到残基的连接
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Cytoscape 2.x 不支持的插件