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CyKEGGParser
KEGG 通路调整器：精确的、组织和蛋白质-蛋白质相互作用特异性的通路
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cyTransFinder
信号转导通路查找器
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KEGGscape
用于 KEGG XML (KGML) 文件的文件读取器和通路可视化工具
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OmniPath
OmniPath：经文献整理的人类信号通路
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ReactomeFIPlugIn
使用 Reactome 功能交互网络探索 Reactome 通路，并搜索与疾病相关的通路和网络模式
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(23) 139158 次下载
Signor App
SIGNORApp 是一个 Cytoscape 3 应用程序，提供对 SIGNOR 资源中注释的因果交互数据的访问。它用于构建网络
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(2) 5045 次下载
CyPath2
Pathway Commons（BioPAX L3 数据库）Web 服务 GUI 客户端应用
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(73) 43178 次下载
ENViz
富集分析与可视化 - 在系统注释背景下，对多个样本匹配数据集进行集成分析
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MetScape
将人类、小鼠和大鼠的代谢组学和基因表达数据映射到人类代谢网络，并支持通路和相关性分析。
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Pathway Scoring Application
评估通路中基因和过程的生物活性
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(2) 10450 次下载
Rene
调控网络增强插件 - ReNE 允许用户增强标准的 KEGG/Reactome 通路
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WikiPathways
WikiPathways Web 服务客户端和 GPML 文件格式导入器
WikiPathways
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Cytoscape 2.x 不支持的插件
bioCycPlugin
加载 bioCyc 数据库中的任何通路。原始面板为每个节点提供有用的信息。
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KGMLReader
KEGG XML (KGML) 文件的文件阅读器和通路可视化器
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ReConn
从 Reactome 服务器加载通路数据并整合表达数据。
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从 Reactome 服务器加载通路数据并整合表达数据。
(0)
GPML-Plugin
通过导入菜单启用 GPML 文件导入。
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Pathintegrator
Pathintegrator 在单个网络中搜索并整合给定基因或蛋白质所参与的通路。
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Pathintegrator 在单个网络中搜索并整合给定基因或蛋白质所参与的通路。
(11)
Superpathways-Plugin
从 Wikipathways 下载并整合多个通路。
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(0)
