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ARACNE
通过 Cyni 解决各种网络去卷积问题的网络推理算法
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CodeNetVis
交互式探索软件系统的依赖关系图
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CyIsomorphism
所有可能的子图同构
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IDARE
多组学数据的数据可视化
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MCDS
近似有向网络中的最小连通支配集 (MCDS)。
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Motif-Discovery
允许用户以快速且友好的方式进行“网络基序发现”。它使用最快的 G-Tries 算法。
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TimeNexus
构建、管理和可视化时间多层网络,并提取活动的多层子网络。
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CentiScaPe
通过计算每个节点的中心性参数,找到网络中最重要的节点。
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CountTriplets
统计图三元组并绘制显著性概况
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Diffusion
使用网络传播算法扩展节点选择
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KDDN
知识融合差异依赖网络 (Knowledge-fused Differential Dependency Network)
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Mclique
给定 Cytoscape 网络中的最大团,按大小排序
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Pesca3.0
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Cytoscape 2.x 不支持的插件
NetDS
网络动力学与结构分析
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