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KEGG 通路调节器：准确的、特定于组织和蛋白质-蛋白质相互作用的通路
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CytoCopteR
一个用于训练逻辑模型的 Cytoscape 插件
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Rene
调控网络增强插件 - ReNE 允许用户使用...增强标准的 KEGG/Reactome 通路
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CySpanningTree
生成树计算以及用于旅行商问题的 MST 启发式算法
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(5) 7475 次下载
Network Randomizer
用于创建随机网络并将其与真实网络进行比较的工具
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TimeNexus
构建、管理和可视化时间多层网络，并提取活跃的多层子网络。
TimeNexus
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Cytoscape 2.x 不支持的插件
addParentNeighbors
对于子网络中的选定节点，从父网络添加相邻节点。
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HyperEdgeEditor
使用户能够通过 Cytoscape 编辑器创建超边。
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(0)
BiNoM
系统生物学文件格式（BioPAX 3 级、SBML、CellDesigner）的导入/导出。生物网络的分析与操作。
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系统生物学文件格式（BioPAX 3 级、SBML、CellDesigner）的导入/导出。生物网络的分析与操作。
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