所有应用

分类

网络分析

搜索有关网络分析的帖子 →

提问有关网络分析的问题 →

ARACNE
通过 Cyni 提供的用于解决各种网络反褶积问题的网络推断算法
ARACNE
通过 Cyni 提供的用于解决各种网络反褶积问题的网络推断算法
(10)  13075 次下载
CentiScaPe
寻找网络中最重要的节点，并为每个节点计算中心性参数。
CentiScaPe
寻找网络中最重要的节点，并为每个节点计算中心性参数。
(40)  72931 次下载
ClustnSee 3
聚类、模块探索和注释
ClustnSee 3
聚类、模块探索和注释
(1)  1408 次下载
CountTriplets
计算图三元组并绘制显著性概况
CountTriplets
计算图三元组并绘制显著性概况
(1)  2817 次下载
CyKEGGParser
KEGG 通路调整器：精确的、组织和蛋白质-蛋白质相互作用特异性的通路
CyKEGGParser
KEGG 通路调整器：精确的、组织和蛋白质-蛋白质相互作用特异性的通路
(14)  64792 次下载
cymirCNV
miRNA 基因相关网络可视化
cymirCNV
miRNA 基因相关网络可视化
(1)  1042 次下载
cytoHubba
通过多种拓扑算法预测和探索给定网络中的重要节点和子网络。
cytoHubba
通过多种拓扑算法预测和探索给定网络中的重要节点和子网络。
(171)  212914 次下载
CytoMOBAS
识别并分析与疾病相关且高度连接的子网络。
CytoMOBAS
识别并分析与疾病相关且高度连接的子网络。
(0)  4122 次下载
Diffusion
使用网络传播算法扩展节点选择
Diffusion
使用网络传播算法扩展节点选择
(35)  40076 次下载
DynDiffNet
一个用于动态差异网络构建、分析和可视化的 Cytoscape 应用
DynDiffNet
一个用于动态差异网络构建、分析和可视化的 Cytoscape 应用
(0)  1289 次下载
DyNetViewer
在 Cytoscape 3.0 中构建、分析和可视化动态网络
DyNetViewer
在 Cytoscape 3.0 中构建、分析和可视化动态网络
(4)  13123 次下载
eXamine
一种用于已注释模块的集合导向视觉分析方法，在节点-链路布局之上以轮廓形式显示集合成员关系。
eXamine
一种用于已注释模块的集合导向视觉分析方法，在节点-链路布局之上以轮廓形式显示集合成员关系。
(34)  24724 次下载
Functional Enrichment Collection
旨在促进功能富集分析的应用合集。安装此应用后，您将同时安装一组相关应用。
Functional Enrichment Collection
旨在促进功能富集分析的应用合集。安装此应用后，您将同时安装一组相关应用。
(5)  37287 次下载
GFD-Net
基于基因本体论 (GO) 分析基因网络，并计算其功能差异的定量指标
GFD-Net
基于基因本体论 (GO) 分析基因网络，并计算其功能差异的定量指标
(55)  19741 次下载
HDR
基于药物和疾病异构网络的药物重定位
HDR
基于药物和疾病异构网络的药物重定位
(1)  7654 次下载
JEPETTO
基于相互作用网络执行人类基因集富集和拓扑分析。
JEPETTO
基于相互作用网络执行人类基因集富集和拓扑分析。
(32)  23268 次下载
Mass Spec Collection
旨在促进质谱数据网络分析的应用合集。安装此应用后，您将同时安装一组相关应用。
Mass Spec Collection
旨在促进质谱数据网络分析的应用合集。安装此应用后，您将同时安装一组相关应用。
(3)  18385 次下载
Mclique
给定 Cytoscape 网络中的最大团，按大小排序
Mclique
给定 Cytoscape 网络中的最大团，按大小排序
(16)  13526 次下载
ModuLand 2.0
提供模块层次结构和可调重叠的模块化方法系列
ModuLand 2.0
提供模块层次结构和可调重叠的模块化方法系列
(2)  10572 次下载
NCMine
通过近团挖掘（Near-Clique Mining）在基因网络中寻找功能模块
NCMine
通过近团挖掘（Near-Clique Mining）在基因网络中寻找功能模块
(3)  4657 次下载
Network Randomizer
一个用于创建随机网络并将其与真实网络进行比较的工具
Network Randomizer
一个用于创建随机网络并将其与真实网络进行比较的工具
(5)  17030 次下载
Omics Analysis Collection
旨在促进组学数据网络分析的应用合集。安装此应用后，您将同时安装一组相关应用。
Omics Analysis Collection
旨在促进组学数据网络分析的应用合集。安装此应用后，您将同时安装一组相关应用。
(1)  25962 次下载
PEmeasure
计算链接权重并评估网络中链接（例如蛋白质-蛋白质相互作用）的可靠性
PEmeasure
计算链接权重并评估网络中链接（例如蛋白质-蛋白质相互作用）的可靠性
(10)  4070 次下载
PEWCC
检测网络（例如 PPI/基因网络）中的密集子网络（例如蛋白质/基因复合物）
PEWCC
检测网络（例如 PPI/基因网络）中的密集子网络（例如蛋白质/基因复合物）
(8)  3987 次下载
PhosphoPath
定量蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学数据集的可视化与分析
PhosphoPath
定量蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学数据集的可视化与分析
(17)  29282 次下载
PSFC
通路信号流计算器：基于基因表达/代谢物丰度和通路拓扑结构计算通路活性。
PSFC
通路信号流计算器：基于基因表达/代谢物丰度和通路拓扑结构计算通路活性。
(1)  24866 次下载
Rene
调节网络增强插件 - ReNE 允许用户增强标准的 KEGG/Reactome 通路
Rene
调节网络增强插件 - ReNE 允许用户增强标准的 KEGG/Reactome 通路
(12)  40877 次下载
RNA
调节网络分析器生成/分析调节网络和状态转换网络，并计算信息熵等信息。
RNA
调节网络分析器生成/分析调节网络和状态转换网络，并计算信息熵等信息。
(2)  14144 次下载
SenseNet
生物分子结构系综的原子相互作用网络分析
SenseNet
生物分子结构系综的原子相互作用网络分析
(1)  6805 次下载
wk-shell-decomposition
执行加权 k-shell 分解
wk-shell-decomposition
执行加权 k-shell 分解
(1)  3781 次下载
ZDOG
ZDOG
(0)  2087 次下载

Cytoscape 2.x 不支持的插件