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BiNGO
计算网络中过度呈现的 GO 条目,并将其显示为显著 GO 条目网络。
BiNGO
计算网络中过度呈现的 GO 条目,并将其显示为显著 GO 条目网络。
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EnrichmentMap
将通路富集可视化为富集图,即一种代表富集通路间重叠的网络。
EnrichmentMap
将通路富集可视化为富集图,即一种代表富集通路间重叠的网络。
(29) 167804 次下载
GOlorize
使用基因本体论 (GO) 类别来指导网络图形布局过程,并强调节点的生物学功能。
GOlorize
使用基因本体论 (GO) 类别来指导网络图形布局过程,并强调节点的生物学功能。
(2) 16564 次下载
PiNGO
在网络中查找与用户定义的目标 GO 条目相关的候选基因。
PiNGO
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UFO
用于统一基于生物医学本体的语义相似度计算、富集分析和可视化的工具
UFO
用于统一基于生物医学本体的语义相似度计算、富集分析和可视化的工具
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ClueGO
创建并可视化功能分组的条目/通路网络
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ENViz
富集分析与可视化——在系统注释背景下对多样本匹配数据集进行综合分析
ENViz
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HGPEC
HGPEC 可以有效预测新型疾病-基因和疾病-疾病关联,并支持基于网络和排名的可视化
HGPEC
HGPEC 可以有效预测新型疾病-基因和疾病-疾病关联,并支持基于网络和排名的可视化
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ReactomeFIPlugIn
使用 Reactome 功能交互网络探索 Reactome 通路,并搜索与疾病相关的通路和网络模式
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使用 Reactome 功能交互网络探索 Reactome 通路,并搜索与疾病相关的通路和网络模式
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Cytoscape 2.x 不支持的插件
Mosaic
系统地划分给定图,并根据 GO 条目对节点进行布局和着色。
Mosaic
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(19)
STOP
本体短语的统计跟踪
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本体短语的统计跟踪
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NOA
网络本体分析插件根据注释节点之间的网络连接执行本体过度表示分析。
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(20)