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功能分析

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	Functional Enrichment Collection (功能富集集合)
	旨在促进功能富集分析的应用程序集合。安装此应用，您将同时安装一组应用程序。

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	旨在促进功能富集分析的应用程序集合。安装此应用，您将同时安装一组应用程序。
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	JEPETTO
	基于交互网络执行人类基因集富集和拓扑分析。

	JEPETTO
	基于交互网络执行人类基因集富集和拓扑分析。
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	Omics Analysis Collection (组学分析集合)
	旨在促进组学数据网络分析的应用程序集合。安装此应用，您将同时安装一组应用程序。

	Omics Analysis Collection (组学分析集合)
	旨在促进组学数据网络分析的应用程序集合。安装此应用，您将同时安装一组应用程序。
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	Rene
	调控网络增强插件 - ReNE 允许用户利用...增强标准的 KEGG/Reactome 通路

	Rene
	调控网络增强插件 - ReNE 允许用户利用...增强标准的 KEGG/Reactome 通路
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	UFO
	一种用于统一基于生物医学本体的语义相似度计算、富集分析和可视化的工具

	UFO
	一种用于统一基于生物医学本体的语义相似度计算、富集分析和可视化的工具
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	HGPEC
	HGPEC 可以有效预测新的疾病-基因和疾病-疾病关联，并支持基于网络和排名的可视化

	HGPEC
	HGPEC 可以有效预测新的疾病-基因和疾病-疾病关联，并支持基于网络和排名的可视化
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	Mass Spec Collection (质谱数据集合)
	旨在促进质谱数据网络分析的应用程序集合。安装此应用，您将同时安装一组应用程序。

	Mass Spec Collection (质谱数据集合)
	旨在促进质谱数据网络分析的应用程序集合。安装此应用，您将同时安装一组应用程序。
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	ReactomeFIPlugIn
	使用 Reactome 功能交互网络探索 Reactome 通路，并搜索与疾病相关的通路和网络模式

	ReactomeFIPlugIn
	使用 Reactome 功能交互网络探索 Reactome 通路，并搜索与疾病相关的通路和网络模式
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	TMM
	从基因表达数据评估端粒维持机制（TMM）的活性。助力 TMM 通路的改进

	TMM
	从基因表达数据评估端粒维持机制（TMM）的活性。助力 TMM 通路的改进
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	WordCloud
	将交互聚类的功能总结为词云图，其中标签的大小代表这些功能出现的频率。

	WordCloud
	将交互聚类的功能总结为词云图，其中标签的大小代表这些功能出现的频率。
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Cytoscape 2.x 不支持的插件

	APID2NET
	从 APID 下载 PPI 数据并执行各种分析和可视化。

	APID2NET
	从 APID 下载 PPI 数据并执行各种分析和可视化。
	(13)

	NetTwo
	测量两个子网络之间的功能关系

	NetTwo
	测量两个子网络之间的功能关系
	(0)

	SimTrek
	评估给定基因及其邻近基因的基因本体相似性。所有文件必须安装在插件文件夹中。

	SimTrek
	评估给定基因及其邻近基因的基因本体相似性。所有文件必须安装在插件文件夹中。
	(0)

	GPEC
	基因优先级排序和生物医学证据收集

	GPEC
	基因优先级排序和生物医学证据收集
	(15)

	NOA
	网络本体分析插件根据注释节点之间的网络连接执行本体过度表示分析。

	NOA
	网络本体分析插件根据注释节点之间的网络连接执行本体过度表示分析。
	(20)

	STOP
	本体短语的统计跟踪

	STOP
	本体短语的统计跟踪
	(4)