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BEL Navigator
在 Cytoscape 3 中探索 OpenBEL 知识网络。
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(0) 3186 次下载
CyNetSVM
一个使用网络约束支持向量机进行癌症生物标志物识别的 Cytoscape 应用。
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cyTransFinder
信号转导通路搜索工具
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(3) 29327 次下载
FileWatcher
一个将网络与 Excel 文件关联的应用
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(0) 4802 次下载
HGPEC
HGPEC 可有效预测新的疾病-基因和疾病-疾病关联，并支持基于网络和排名的可视化
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(2) 4392 次下载
iRegulon
检测主调节因子和顺式调节相互作用
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(12) 39262 次下载
KDDN
知识融合差异依赖网络 (Knowledge-fused Differential Dependency Network)
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(7) 7775 次下载
ncINetView
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PINA4MS
结合组织特异性蛋白质表达和相互作用数据，以识别具有功能和疾病相关性的基因
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(14) 16499 次下载
RWRMTN
一种基于微小 RNA-靶基因网络预测疾病相关 microRNA 的工具
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(4) 3724 次下载
TMM
从基因表达数据评估端粒维持机制 (Telomere Maintenance Mechanisms) 的活性。致力于改进 TMM 通路
TMM
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CyNDEx-2
核心应用：CyNDEx-2 是一款用户友好的应用程序，用于浏览、导入网络到 NDEx 服务器以及从 NDEx 服务器导出网络。
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核心应用：CyNDEx-2 是一款用户友好的应用程序，用于浏览、导入网络到 NDEx 服务器以及从 NDEx 服务器导出网络。
(4) 68550 次下载
CyTargetLinker
灵活的网络扩展应用
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ENViz
富集分析与可视化 - 在系统注释的背景下，对多个样本匹配数据集进行综合分析
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(14) 41825 次下载
General SPARQL
导航 SPARQL 端点。附带一套预定义的 SPARQL 查询，可与来自 EBI RDF 平台和 Bio2RDF 的公共端点配合使用
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ID Mapper
BridgeDB 服务的插件，用于提供标识符查询。右键点击列标题以使用“映射列”命令。
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JGF App
导入/导出 OpenBEL 网络。JSON 图形格式网络应用，可处理更严格的 BEL 模式。
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KEGGscape
用于 KEGG XML (KGML) 文件的文件读取器和通路可视化工具
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NeDRex
寻找药物重定位候选药物和疾病模块。构建自定义异构分子网络并支持探索
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PTMOracle
PTM（翻译后修饰）和 PPI（蛋白质-蛋白质相互作用）数据的联合可视化和联合分析
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(4) 10231 次下载
Synapse Client
在 Cytoscape 内访问您在 Synapse.org 上的数据
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Vital AI Graph Visualization
使用 Vital AI 软件连接到数据库、服务器和 Hadoop/Spark
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Cytoscape 2.x 不支持的插件
CytoHiCPlugin
CytoHiC：Hi-C 网络的可视化比较
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HOMECAT
整合来自多个物种的数据，映射多个直系同源基因
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整合来自多个物种的数据，映射多个直系同源基因
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Pathintegrator
Pathintegrator 在单个网络中搜索并整合给定基因或蛋白质所参与的通路。
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GPEC
基因优先级排序和生物医学证据收集
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KGMLReader
KEGG XML (KGML) 文件的文件阅读器和通路可视化器
KGMLReader
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(61)
