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CyFinder
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cytoHubba
通过多种拓扑算法预测和探索给定网络中的重要节点和子网络。
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PEWCC
检测网络(如 PPI/基因网络)中的密集子网络(如蛋白质/基因复合体)
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TimeNexus
构建、管理和可视化时间多层网络,并提取活跃的多层子网络。
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CySpanningTree
用于旅行商问题的生成树计算和最小生成树启发式算法
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Mclique
给定 Cytoscape 网络中的极大团,按大小排序
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TieDIE
通过交互事件的关联扩散 (Tied Diffusion Through Interacting Events)
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