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CytoGTA
基于基因表达的 PPI 网络模块(聚类)检测
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Diffusion
使用网络传播算法扩展节点选择
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TieDIE
通过交互事件进行关联扩散 (Tied Diffusion Through Interacting Events)
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ZDOG
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CyNetSVM
一款使用网络约束支持向量机进行癌症生物标志物鉴定的 Cytoscape 应用
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DeDaL
数据驱动布局 (PCA等)、网络比对、网络形态转换。
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ReactomeFIPlugIn
使用 Reactome 功能交互网络探索 Reactome 通路,并搜索与疾病相关的通路和网络模式
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TMM
根据基因表达数据评估端粒维持机制 (Telomere Maintenance Mechanisms) 的活性。为改进 TMM 通路做出贡献
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Cytoscape 2.x 不支持的插件