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	CyAnimator
	为 Cytoscape 提供的简单关键帧动画

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	功能富集集合
	用于促进功能富集分析的应用程序集合。安装此应用将同时安装一组应用程序。

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	组学分析集合
	用于促进组学数据网络分析的应用程序集合。安装此应用将同时安装一组应用程序。

	组学分析集合
	用于促进组学数据网络分析的应用程序集合。安装此应用将同时安装一组应用程序。
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	DynNetwork
	在 Cytoscape 3.0 中可视化动态网络

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	质谱分析集合
	用于促进质谱数据网络分析的应用程序集合。安装此应用将同时安装一组应用程序。

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	用于促进质谱数据网络分析的应用程序集合。安装此应用将同时安装一组应用程序。
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Cytoscape 2.x 不支持的插件

	clusterMaker
	对给定网络中紧密连接的节点和节点属性进行聚类。

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	对给定网络中紧密连接的节点和节点属性进行聚类。
	(22)

	VistaClaraPlugin
	提供有效且可视化的分析平台，用于分析给定网络上的表达数据。

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	(5)

	dynamicXpr
	像电影一样，根据节点在多种条件下的表达水平动态改变其颜色。

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	像电影一样，根据节点在多种条件下的表达水平动态改变其颜色。
	(2)