DisGeNET-app

查询、分析和可视化 DISGENET 数据
DISGENET Cytoscape App 旨在可视化、查询和分析 DISGENET 数据的网络表示。它通过各种内置功能协助用户解释和探索人类疾病的遗传基础。通过 DISGENET Cytoscape App,用户可以轻松生成基因-疾病和变异-疾病网络。这些网络可以根据以下内容进行自定义:(i) 原始数据来源 (ii) 感兴趣的蛋白质类别 (iii) 感兴趣的疾病类别 (iv) 特定疾病、基因或变异,以及它们的列表和组合 (v) 一系列评分或证据指数 (Evidence Index)。该应用还支持:<p> 1. 按疾病类别对节点进行着色 <p> 2. 通过 REST 访问数据 <p> 3. 按数据源扩展节点信息 <p> 4. 对基因和变异网络执行富集分析 <p> 5. 使用疾病信息轻松注释外部蛋白质和变异网络 <p> **使用条款** <p> 位于 <https://www.disgenet.com> 的 DISGENET 数据库和知识发现平台由 [https://www.medbioinformatics.com Medbioinformatics Solutions SL] 提供,旨在促进人类疾病及其相关基因和变异知识的发展。DISGENET 的商业用途需支付许可费。计划将 DISGENET 用于非商业用途的非营利机构用户可申请免费访问(通过学术许可)。计划将 DISGENET 用于商业目的和/或属于营利性组织的用户必须付费购买 DISGENET 许可。

8.2.3

兼容版本 Cytoscape 3.6

API   pom.xml   Javadocs

发布说明

数据版本更新至 v26.1,API 版本更新至 1.9.4

8.2.2

兼容版本 Cytoscape 3.6

API   pom.xml   Javadocs

发布说明

新增 GDA 来源:CLINPGX;新增 VDA 来源:CLINPGX

8.2.1

兼容版本 Cytoscape 3.6

API   pom.xml   Javadocs

发布说明

新增 GDA 来源:GenCC;新增 VDA 来源:ClinGen

8.2.0

兼容版本 Cytoscape 3.6

API   pom.xml   Javadocs

发布说明

新增数据源:UKBIOBANK 和 FINNGEN。更改了 DISGENET 样式(删除旧样式以查看更改)。修复了证据指数 (Evidence Index) 的 Bug。

8.1.2

兼容版本 Cytoscape 3.6

API   pom.xml   Javadocs

发布说明

疾病富集分析现在支持最多 4,000 个实体的列表

8.1.1

兼容版本 Cytoscape 3.6

API   pom.xml   Javadocs

发布说明

修复了搜索框中的 Bug

8.1

兼容版本 Cytoscape 3.6

API   pom.xml   Javadocs

发布说明

DISGENET 富集功能现已在应用中可用,允许对外部基因和变异网络以及 DISGENET 数据进行富集分析。

8.0.3

兼容版本 Cytoscape 3.6

API   pom.xml   Javadocs

发布说明

**1. 增强的查询功能:** 您现在可以在单个查询中包含多达 100 个逗号分隔的实体(基因、变异和疾病)。**2. 改进的基因搜索:** 增强了 NCBI 基因 ID 的搜索功能。更新后的搜索算法可提供更准确和相关的结果。**3. 扩展的实体建议:** 实体搜索(基因、变异、疾病)现在提供扩展的建议。系统提供了更广泛、更全面的建议范围。**4. 更好的错误处理:** 错误处理得到了显著改进,特别是在参数不准确或不精确的情况下。系统现在更加稳健,并提供更清晰的错误消息。

8.0.2

兼容版本 Cytoscape 3.6

API   pom.xml   Javadocs

发布说明

现在,用户可以查询更长的基因和疾病列表(最多 25 个实体)。在基因、疾病和变异搜索框中也添加了自动补全功能。

8.0.1

兼容版本 Cytoscape 3.6

API   pom.xml   Javadocs


8.0.0

兼容版本 Cytoscape 3.6

API   pom.xml   Javadocs


7.3.0

兼容版本 Cytoscape 3.6

API   pom.xml   Javadocs

发布说明

在富集功能中添加了新参数

7.2.6

兼容版本 Cytoscape 3.6

API   pom.xml   Javadocs

发布说明

修复了异常

7.2.5

兼容版本 Cytoscape 3.6

API   pom.xml   Javadocs

发布说明

修复了少量 Bug

7.2.4

兼容版本 Cytoscape 3.6

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发布说明

富集面板的参数与 DisGeNET REST API 富集保持一致

7.2.3

兼容版本 Cytoscape 3.6

API   pom.xml   Javadocs

发布说明

移除了基因和疾病投影;解决了富集分析中的 Bug

7.2.2

兼容版本 Cytoscape 3.6

API   pom.xml   Javadocs

发布说明

修复了富集边缘的 Bug

7.2.1

兼容版本 Cytoscape 3.6

API   pom.xml   Javadocs

发布说明

修复了富集 p 值相关的 Bug

7.2.0

兼容版本 Cytoscape 3.6

API   pom.xml   Javadocs

发布说明

我们将变异和基因网络的疾病富集功能添加到了 Cytoscape REST API 的端点中

7.1.1

兼容版本 Cytoscape 3.6

API   pom.xml   Javadocs


7.1.0

兼容版本 Cytoscape 3.6

API   pom.xml   Javadocs


7.0.0

兼容版本 Cytoscape 3.6

API   pom.xml   Javadocs


6.3.2

兼容版本 Cytoscape 3.6


6.3.1

兼容版本 Cytoscape 3.6

API   pom.xml   Javadocs


6.3.0

兼容版本 Cytoscape 3.6


6.2.2

兼容版本 Cytoscape 3.6

API   pom.xml   Javadocs

发布说明

已添加 ClinVar、GWAS catalog 和 GWASdb 作为基因-疾病网络源

6.2.1

兼容版本 Cytoscape 3.6

API   pom.xml   Javadocs

发布说明

在外部网络注释菜单中添加了新过滤器;修复了外部网络注释菜单中证据级别过滤器的一个小 Bug

6.2.0

兼容版本 Cytoscape 3.6

API   pom.xml   Javadocs

发布说明

增加了更改数据库位置的可能性;为展开功能和注释外部网络实现了新的过滤器

6.0.3

兼容版本 Cytoscape 3.6

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发布说明

修复了 VDA 选项卡中基因框内通配符搜索的 Bug;修复了 VDA 选项卡中按关联类型过滤的 Bug

6.0.2

兼容版本 Cytoscape 3.6

API   pom.xml   Javadocs

发布说明

修复了展开基因功能

6.0.1

兼容版本 Cytoscape 3.6

API   pom.xml   Javadocs


6.0.0

兼容版本 Cytoscape 3.6

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5.4.0

兼容版本 Cytoscape 3.6

API   pom.xml   Javadocs


5.3

兼容版本 Cytoscape 3.6

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5.2

兼容版本 Cytoscape 3.6

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发布说明

增加了自动化功能

5.1

兼容版本 Cytoscape 3.6

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发布说明

修正了 Bug;添加了探索变异-疾病关联的工具

5.0

兼容版本 Cytoscape 3.2

API   pom.xml   Javadocs


1.0

兼容版本 Cytoscape 3.2

API   pom.xml   Javadocs


CYTOSCAPE 3

版本 8.2.3

发布于 2026 年 4 月 8 日

兼容版本 Cytoscape 3.6

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