BridgeDb

使用 BridgeDb 和其他公共或自定义数据库源执行 ID 映射。
BridgeDb 应用(在 Cytoscape 2.8 中曾被称为 CyThesaurus)是一款 Cytoscape 应用,可基于多种资源执行标识符(ID)映射服务。BridgeDb 提供了将源 ID 类型的属性映射为目标 ID 类型的新属性的实用工具。目前,该应用支持来自带分隔符的文本、BridgeDb 文件、BridgeDb 网络服务和 BioMart 网络服务的 ID 映射资源。此应用使用了 [http://bridgedb.org/ BridgeDb API]。BridgeDb 项目还为 WikiPathways、Pathvisio、GenMAPP-CS 和许多其他生物信息学工具提供了关系数据库内容,这些内容主要基于从 Ensembl 数据库资源中提取的内容和关系。

1.2.0

兼容性 Cytoscape 3.1


1.1.0.2

兼容性 Cytoscape 3.1

依赖此版本的应用

发布说明

对用户界面进行了一些细微的改进,包括链接到 BridgeDb Derby 文件目录,以及对部分术语进行了调整,例如将“属性 (attributes)”更改为“列 (columns)”。

1.1.0.1

兼容性 Cytoscape 3.1

发布说明

修复了一些小问题。

1.1.0

兼容性 Cytoscape 3.1

发布说明

第一个支持 Cytoscape 3.x 的版本。目前该应用支持来自带分隔符的文本、BridgeDb 文件、BridgeDb 网络服务和 BioMart 网络服务的 ID 映射资源。它基于 BridgeDb API 1.1.0。

CYTOSCAPE 3

版本 1.2.0

发布日期 2020 年 9 月 10 日

兼容版本 Cytoscape 3.1

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